Doctrine, $dao->save() DEPRECATED – jaky zvolit tedy korektni pristup?

Zdravim,
hraju si s doctrine v nette
mam klasickou tridu Customers, ktera se stara o entity typu Customer. (rika se vlastne te tride Customers fasada, pokud obsahuje nejakou urcitou logiku? – findCustomernameByEmail(..) atd?)

Mam tedy napr. tento kod (inspirace zeminemem – diky!)

<?php
class Customers extends Nette\Object
{
	public function findBy(array $criteria, array $orderBy = NULL, $limit = NULL, $offset = NULL)
	{
		return $this->dao->findBy($criteria, $orderBy, $limit, $offset);
	}
	public function findOneBy(array $criteria, array $orderBy = NULL)
	{
		return $this->dao->findOneBy($criteria, $orderBy);
	}
	public function save($entity = NULL, $relations = NULL)
	{
		return $this->dao->save($entity, $relations);
	}
	public function delete($entity, $relations = NULL, $flush = Kdyby\Persistence\ObjectDao::FLUSH)
	{
		$this->dao->delete($entity, $relations, $flush);
	}
	// atd
?>

1. problem je, ze phpstorm mi ukazuje, ze metody save a delete jsou deprecated a ze bych mel pouzit misto toho persist() a flush() – je to zejmena z toho duvodu, ze flush je casove narocnejsi akci a ze bych tedy mel idealne flushovat vice zmen najednou?
2. jak to tedy uchopit v pripade, ze save, a deleted jsou deprecated? normalne zavolat na entityManageru persist a flush v ramci metody save()? to bych si ale defakto vubec nepomohl. Nebo flushovat v presenteru v pripade, ze provedu v instanci Customers vice akci? to mi zase prijde, ze by se na to casto mohlo zapomenout

moc diky za pripadny navedeni a sorry za moje neomalene formulace :)

J.